Веб приложения довольно обширное понятие и сюда входит целый класс приложений. Сайты являются частью веб приложений. Веб приложение это более общее понятие, которое символизирует, что приложение (программа) работает через сеть и в браузере. Самыми яркими примерами веб приложений являются сайты таких компаний, как - ВКонткте, Фейсбук, Инстраграмм. Это не просто сайты, это целый комплекс программного обеспечения, который объёдинен в сайт и пользоваться им можно через браузер.